Actualmente el CMU no atiende directamente a afiliados a EPS. Sin embargo, hay algunas EPS con las que la Universidad tiene un convenio para que los médicos de esas entidades atiendan en el CMU a los funcionarios de la universidad que estén afiliados, coordinado a través de Gestión Humana y sólo aplica para los funcionarios, no para los estudiantes.
Bajo este esquema, estas son las EPS que se atienden:
- EPS Sura
- EPS Sanitas
- Nueva EPS
- COOMEVA EPS
- Salud Total EPS