Son varias las diferencias existentes entre la conciliación prejudicial en derecho y un proceso judicial. Entre las más relevantes podremos encontrar que en una audiencia de conciliación prejudicial las partes podrán trabajar en el acuerdo conciliatorio con la ayuda del conciliador, por esto es un mecanismo autocompositivo. En un proceso judicial, será el juez quien luego del estudio del caso expida una sentencia con la decisión final. También es importante mencionar que la conciliación prejudicial antecede al proceso judicial buscando evitar esta instancia jurídica y para acceder a este mecanismo no requieres abogado como sí ocurre en un proceso judicial.